186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51303 on replicon NC_011701
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  46.38 
 
 
484 aa  151  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  41.51 
 
 
563 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  41.26 
 
 
194 aa  138  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  28.5 
 
 
424 aa  99  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  30.2 
 
 
288 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  32.32 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  43.75 
 
 
951 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  43.75 
 
 
931 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  38.83 
 
 
119 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  46.67 
 
 
90 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  27.49 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  41.82 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  50 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  41.82 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  45.95 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  49.35 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
89 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  45.95 
 
 
90 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
90 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  49.35 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 
90 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  27.5 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  40.54 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  43.06 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  46.15 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
90 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  44.87 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.73 
 
 
572 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  46.15 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  46.15 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
157 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
148 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
150 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  41.67 
 
 
99 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
132 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  29.5 
 
 
524 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  44.16 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
137 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  41.77 
 
 
114 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  41.56 
 
 
103 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  42.31 
 
 
134 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  43.59 
 
 
115 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  29.65 
 
 
434 aa  58.9  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  42.86 
 
 
105 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  38.96 
 
 
143 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  22.5 
 
 
732 aa  58.2  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25 
 
 
552 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.96 
 
 
97 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  40.51 
 
 
95 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  47.3 
 
 
85 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
104 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
122 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
92 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  42.31 
 
 
123 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  38.46 
 
 
116 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  22 
 
 
673 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
122 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
140 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  24.62 
 
 
481 aa  55.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  39.74 
 
 
107 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
87 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
82 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  26 
 
 
605 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  42.31 
 
 
89 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  43.42 
 
 
85 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
121 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  27.23 
 
 
724 aa  55.1  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
114 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  39.56 
 
 
98 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  39.47 
 
 
107 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
124 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
82 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  35.37 
 
 
127 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
101 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  26.96 
 
 
516 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
81 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  38.27 
 
 
104 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  38.67 
 
 
837 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  26.18 
 
 
161 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 
207 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  37.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  38.03 
 
 
274 aa  51.6  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  25.74 
 
 
352 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
108 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 
480 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
91 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
125 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
89 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  26.42 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  32.86 
 
 
76 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  32.47 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>