219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13520 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  100 
 
 
127 aa  263  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  48.03 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06142  small subunit of nuclear cap-binding protein complex (AFU_orthologue; AFUA_2G08570)  50.82 
 
 
185 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.040408  normal  0.207556 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04290  20 kda nuclear cap binding protein (ncbp), putative  53.15 
 
 
195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37507  small subunit of the nuclear mRNA cap-binding protein complex CBC  44.34 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201062  normal  0.0819638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  44 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  38.96 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  38.37 
 
 
441 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  44.59 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  34.31 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
207 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  41.33 
 
 
497 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  38.36 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  37.84 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  39.19 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.89 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  32.95 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  31.17 
 
 
455 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  43.06 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  31.25 
 
 
769 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  36.99 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34 
 
 
101 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  36.25 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  35.37 
 
 
222 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.3 
 
 
241 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
90 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.49 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  34.72 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
181 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  31.51 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  30.38 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  31.4 
 
 
1121 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  31.4 
 
 
572 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  29.73 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  29.73 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  32.94 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  31.58 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  34.15 
 
 
103 aa  48.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  33.75 
 
 
319 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  31.33 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36.11 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.88 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  38.16 
 
 
328 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  34.62 
 
 
524 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>