35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02730 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  100 
 
 		 274 aa  523  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  37.74 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  31.95 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  26.38 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  39.71 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1339  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 		 627 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.476364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  35 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  50 
 
 		 631 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 		 115 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  31.75 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  45.56 
 
 		 674 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  27.52 
 
 		 563 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 		 148 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 116 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 		 150 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  33.33 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  27.18 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 157 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  31.25 
 
 		 162 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 121 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  21.14 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  24.34 
 
 		 424 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  28.17 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  28.75 
 
 		 104 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  31.33 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>