41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85825 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  100 
 
 		 271 aa  518  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  29.51 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  26.38 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  32.8 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25.39 
 
 		 441 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  33.72 
 
 		 142 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  34.18 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.49 
 
 		 724 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  31.71 
 
 		 837 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  35 
 
 		 769 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 94 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 94 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  30.67 
 
 		 870 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31452  predicted protein  37.68 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  25.69 
 
 		 632 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  31.4 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  32.5 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  28.05 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  23.42 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 103 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  29.89 
 
 		 874 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  31.17 
 
 		 97 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  28.05 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 99 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 125 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  27.4 
 
 		 81 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 		 105 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 92 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  31.71 
 
 		 89 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  30.95 
 
 		 97 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  29.11 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 		 112 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  25.89 
 
 		 484 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  28.4 
 
 		 101 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>