56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7426 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  100 
 
 		 81 aa  170  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  50 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  44.74 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  40 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  39.47 
 
 		 424 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  38.67 
 
 		 563 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  36.99 
 
 		 499 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  31.75 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.49 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  30 
 
 		 931 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  30 
 
 		 951 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  33.33 
 
 		 605 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  34.72 
 
 		 732 aa  43.9  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  30.77 
 
 		 455 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  31.58 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.47 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  26.67 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.94 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.17 
 
 		 724 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  37.04 
 
 		 291 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  34.72 
 
 		 572 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  30 
 
 		 874 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  29.85 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  35.53 
 
 		 319 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 88 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>