131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84007 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  100 
 
 		 439 aa  862    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  35.96 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  36.22 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67695  suppressor of DNA polymerase and splicing mutations  30.39 
 
 		 818 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 		 101 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  36.08 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  44.58 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 		 99 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 		 96 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  42.86 
 
 		 112 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25349  predicted protein  30.98 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  42.86 
 
 		 107 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  41.79 
 
 		 1068 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 88 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 83 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 98 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  39.24 
 
 		 77 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  41.46 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  44.59 
 
 		 89 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 		 89 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 101 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 		 99 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  36.08 
 
 		 98 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.08 
 
 		 98 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  43.37 
 
 		 95 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  36.96 
 
 		 102 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  40.54 
 
 		 85 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  39.47 
 
 		 91 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 88 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 92 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  39.76 
 
 		 103 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 		 87 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  38.95 
 
 		 105 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 88 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  37.8 
 
 		 143 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 		 88 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 86 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  44.16 
 
 		 837 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 88 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  33.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 		 81 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 		 111 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  36.99 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 		 90 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.68 
 
 		 97 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 90 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.51 
 
 		 109 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 91 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 		 173 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 116 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 98 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  38.16 
 
 		 129 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 115 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  38.16 
 
 		 128 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 88 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  38.75 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43274  predicted protein  25.85 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.758064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 		 202 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.46 
 
 		 76 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  33.33 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 		 81 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  32.53 
 
 		 140 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 146 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  35.23 
 
 		 1290 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 		 250 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  34.95 
 
 		 102 aa  47  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  34.95 
 
 		 102 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 		 250 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  29.17 
 
 		 524 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  37.65 
 
 		 103 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  35.16 
 
 		 151 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  32.95 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  34.21 
 
 		 269 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 90 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.36 
 
 		 92 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 82 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  35.87 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 123 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 94 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  34.15 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  37.96 
 
 		 874 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  36.59 
 
 		 97 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 102 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 94 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  37.36 
 
 		 92 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 96 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  41.03 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 		 81 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 122 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  32.5 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>