162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49481 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  100 
 
 
1068 aa  2211    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_37027  predicted protein  70.13 
 
 
352 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0567529  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  34.12 
 
 
84 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
88 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
85 aa  61.6  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  26.55 
 
 
575 aa  61.6  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16466  predicted protein  25.5 
 
 
465 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  41.25 
 
 
99 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
91 aa  60.1  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  37.07 
 
 
128 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  37.66 
 
 
77 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  40 
 
 
182 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
207 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  39.76 
 
 
85 aa  59.3  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
90 aa  58.9  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
125 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
137 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 
90 aa  57  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
90 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  24.33 
 
 
611 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  34.12 
 
 
250 aa  56.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.12 
 
 
250 aa  56.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
88 aa  55.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
102 aa  55.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
102 aa  55.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  41.79 
 
 
439 aa  55.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  34.78 
 
 
115 aa  55.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  40 
 
 
96 aa  55.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  30.68 
 
 
161 aa  55.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
95 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
95 aa  54.3  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.36 
 
 
94 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
98 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.36 
 
 
94 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  34.57 
 
 
104 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
99 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
90 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.94 
 
 
202 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
90 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
98 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
101 aa  52.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
98 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.94 
 
 
196 aa  53.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
88 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04000  cytoplasm protein, putative  28.23 
 
 
455 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  33.75 
 
 
222 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.83 
 
 
89 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
146 aa  52.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
87 aa  52.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  26.47 
 
 
488 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 
95 aa  52  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.83 
 
 
102 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  36.25 
 
 
97 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
96 aa  52  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  34.52 
 
 
89 aa  52  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
81 aa  52  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 
222 aa  51.6  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
99 aa  51.6  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
90 aa  51.6  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
82 aa  51.6  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
90 aa  51.6  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
90 aa  51.6  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  37.33 
 
 
524 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 
82 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  31.76 
 
 
173 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
89 aa  50.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  32.29 
 
 
160 aa  51.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
88 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
89 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  41.67 
 
 
123 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  33.75 
 
 
82 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
155 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
88 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
103 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  35.87 
 
 
837 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  34.94 
 
 
559 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.51 
 
 
109 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  31.96 
 
 
100 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 
105 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
104 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
149 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.5 
 
 
203 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  32.97 
 
 
490 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
101 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.94 
 
 
245 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
156 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  35.37 
 
 
441 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 
90 aa  50.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
90 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 
122 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
157 aa  49.3  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  30.85 
 
 
152 aa  49.3  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32.22 
 
 
97 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
99 aa  48.9  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
87 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
92 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  30.91 
 
 
155 aa  48.9  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
92 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
89 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>