32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00210 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  100 
 
 		 512 aa  1014    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  46.2 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  33.33 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25349  predicted protein  37.86 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  37.08 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  40.79 
 
 		 76 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  35.37 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 		 87 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04748  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06310)  36.67 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311535  normal  0.626958 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  26.04 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 		 81 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 		 89 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 153 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  31.96 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  31.71 
 
 		 161 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  31.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 86 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  35.23 
 
 		 152 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  29.75 
 
 		 516 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  36.36 
 
 		 107 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  28.57 
 
 		 450 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  37.18 
 
 		 143 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 147 aa  43.1  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>