33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25349 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_25349  predicted protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  37.86 
 
 		 512 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  46.75 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 		 87 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  34 
 
 		 439 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32836  predicted protein  34.95 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 88 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 		 86 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 		 83 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 88 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 		 88 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  33.72 
 
 		 497 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 		 89 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 		 81 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  36.25 
 
 		 441 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43274  predicted protein  29.38 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.758064  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  35.71 
 
 		 434 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  37.8 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  30.48 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  25.64 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  38.75 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04748  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06310)  34.26 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311535  normal  0.626958 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28172  predicted protein  32.73 
 
 		 568 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0175348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 88 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  32 
 
 		 76 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  30.69 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  34.18 
 
 		 173 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  35.05 
 
 		 99 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  36.59 
 
 		 196 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  33.8 
 
 		 88 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 87 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>