89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31221 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  100 
 
 		 727 aa  1487    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  25.32 
 
 		 1290 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 		 85 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  33.33 
 
 		 559 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  40.85 
 
 		 552 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  35.44 
 
 		 516 aa  54.3  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.54724 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  36.36 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 83 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  38.16 
 
 		 245 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  40.26 
 
 		 95 aa  53.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  42.31 
 
 		 182 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 103 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 104 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 		 157 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 96 aa  52  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 		 87 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 		 162 aa  51.6  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 		 91 aa  51.2  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  37.93 
 
 		 89 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  38.1 
 
 		 870 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 132 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  39.24 
 
 		 81 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  30.67 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 181 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 176 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 176 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 		 134 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 		 151 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 88 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  51.11 
 
 		 524 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 110 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 149 aa  48.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 		 114 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 155 aa  48.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 137 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 		 82 aa  47.8  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 152 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  31.58 
 
 		 119 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 89 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  26.09 
 
 		 246 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 		 81 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 		 101 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  40.58 
 
 		 303 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  38.04 
 
 		 128 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  37.08 
 
 		 95 aa  47.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 98 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  39.53 
 
 		 99 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31379  predicted protein  24.31 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.828555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  35 
 
 		 99 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  39.76 
 
 		 94 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  32.47 
 
 		 81 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 148 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 		 105 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  34.52 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  36.92 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 125 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 87 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  34.12 
 
 		 694 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  36.73 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 175 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 90 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  37.68 
 
 		 605 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  42.19 
 
 		 94 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  38.37 
 
 		 143 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  34.04 
 
 		 97 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 123 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 108 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.95 
 
 		 102 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  38.16 
 
 		 128 aa  44.3  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  43.33 
 
 		 999 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 121 aa  44.3  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 		 88 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  39.02 
 
 		 196 aa  44.3  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  38.16 
 
 		 129 aa  44.3  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  31.65 
 
 		 82 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  31.65 
 
 		 82 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 103 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 85 aa  43.9  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.67 
 
 		 107 aa  43.9  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 109 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 121 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>