20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06850 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  100 
 
 		 449 aa  899    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  33.01 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  32.89 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  27.07 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  23.5 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  21.97 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  31.63 
 
 		 86 aa  53.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  26.27 
 
 		 819 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  27.66 
 
 		 687 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  30 
 
 		 563 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  22.02 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  24.66 
 
 		 838 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  29.2 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  29.59 
 
 		 76 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  31.86 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.65 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  31.03 
 
 		 332 aa  43.5  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  28.43 
 
 		 187 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  21.95 
 
 		 303 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  25.12 
 
 		 288 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>