11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00230 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00230  RNA binding protein, putative  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  36.51 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766203 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13360  predicted protein  32.55 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40739  predicted protein  30.35 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48819  predicted protein  27.75 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05779  U1 small nuclear ribonucleoprotein A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06490)  38.89 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35154  predicted protein  30.21 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  23.6 
 
 		 769 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  37.84 
 
 		 122 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0484307 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00870  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709286  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  36.99 
 
 		 102 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>