23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13360 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13360  predicted protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48819  predicted protein  35.68 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  31.88 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766203 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05779  U1 small nuclear ribonucleoprotein A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06490)  52.04 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00230  RNA binding protein, putative  31.22 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40739  predicted protein  29.74 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00870  hypothetical protein  46.73 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709286  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35154  predicted protein  40.22 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  26.61 
 
 		 1290 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  26.67 
 
 		 724 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  34.57 
 
 		 102 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  39.53 
 
 		 99 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 		 101 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  31.25 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 		 98 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  31.34 
 
 		 122 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0484307 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07700  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08330)  37.21 
 
 		 628 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 615 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  34.88 
 
 		 109 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  27.38 
 
 		 769 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  34.04 
 
 		 97 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  38 
 
 		 99 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>