67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01220 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA01220  cyclophilin, putative  100 
 
 		 135 aa  283  8e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  36.28 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  34.07 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  29.49 
 
 		 605 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.76 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  29.76 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  29.79 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  29.79 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  27.96 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  32.35 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  31.82 
 
 		 477 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  32.22 
 
 		 246 aa  47  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.76 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  29.35 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  24.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  29.58 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  26.19 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  27.37 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50310  predicted protein  30.16 
 
 		 699 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.049035  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  37.93 
 
 		 434 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  25.25 
 
 		 1290 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  29.27 
 
 		 453 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  40.3 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12366  predicted protein  30.12 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  26.92 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  29.55 
 
 		 481 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  25.58 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  28.57 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  33.82 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  29.03 
 
 		 572 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  30.14 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  30.59 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  33.82 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  32.35 
 
 		 162 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  29.35 
 
 		 94 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  29.35 
 
 		 94 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  26.19 
 
 		 95 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  25 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1121 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 		 90 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  27.91 
 
 		 98 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  25 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25 
 
 		 441 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  27.91 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.82 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  33.33 
 
 		 559 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  26.19 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  26.09 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  27.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  28.4 
 
 		 234 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  25 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  28.12 
 
 		 732 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.35 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  36.76 
 
 		 837 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  34.29 
 
 		 271 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>