24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06030 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06030  RNA binding protein, putative  100 
 
 		 393 aa  723    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  34.38 
 
 		 97 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9485  predicted protein  33.75 
 
 		 107 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0359849  normal  0.11207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 		 99 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26750  predicted protein  29.09 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 101 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  28.77 
 
 		 856 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  22.94 
 
 		 687 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 105 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  27.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 99 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 		 109 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 89 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  31.34 
 
 		 102 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  37.5 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 110 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  31.17 
 
 		 89 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 92 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 92 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47737  predicted protein  31.71 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>