80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03072 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  100 
 
 		 856 aa  1747    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  40.96 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  37.18 
 
 		 450 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  34.62 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  33.33 
 
 		 245 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  37.66 
 
 		 424 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  34.18 
 
 		 122 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  33.33 
 
 		 605 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  27.91 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  33.33 
 
 		 446 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_13471  RNA-binding protein  32.88 
 
 		 165 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 207 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  32.43 
 
 		 76 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  33.33 
 
 		 838 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 90 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  31.94 
 
 		 84 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  28.81 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 104 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  36.76 
 
 		 217 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 97 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 		 122 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.93 
 
 		 86 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  27 
 
 		 303 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 105 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.92 
 
 		 103 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  32.5 
 
 		 837 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 114 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  29.87 
 
 		 173 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 		 102 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  24.85 
 
 		 499 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 90 aa  47.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  33.33 
 
 		 277 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06030  RNA binding protein, putative  28 
 
 		 393 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 373 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 88 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  29.73 
 
 		 95 aa  47.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 102 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 		 110 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 		 222 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 98 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 90 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  30.99 
 
 		 119 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 		 90 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  28.77 
 
 		 870 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  36.67 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 98 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  26.85 
 
 		 161 aa  46.2  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  36.07 
 
 		 96 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  29.41 
 
 		 387 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 88 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 101 aa  45.8  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  29.29 
 
 		 151 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  28.57 
 
 		 497 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  27.63 
 
 		 319 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  28 
 
 		 107 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  26.61 
 
 		 107 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  29.82 
 
 		 152 aa  45.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  32.08 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  28.23 
 
 		 769 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  28.77 
 
 		 99 aa  45.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 87 aa  45.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 109 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  28.38 
 
 		 82 aa  44.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 99 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  33.33 
 
 		 481 aa  44.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  26.58 
 
 		 874 aa  44.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  27.03 
 
 		 340 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 92 aa  44.3  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  26.39 
 
 		 90 aa  44.3  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  30.56 
 
 		 353 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  31.08 
 
 		 307 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 90 aa  44.3  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>