207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06676 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  100 
 
 
307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  48.51 
 
 
253 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  44.35 
 
 
287 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  36.21 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
108 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  41.25 
 
 
95 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  35.79 
 
 
157 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
114 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
115 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  40.26 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  41.67 
 
 
105 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  39.29 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
82 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.05 
 
 
173 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  39.6 
 
 
108 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
122 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  34.21 
 
 
184 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
98 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
98 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.36 
 
 
119 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1930  RNA-binding region RNP-1  36.14 
 
 
89 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
176 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
124 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  43.9 
 
 
107 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  40.48 
 
 
103 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  35.63 
 
 
123 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
176 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.09 
 
 
90 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
101 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  30.21 
 
 
874 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  34.44 
 
 
499 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  32.43 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1253  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
134 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000895095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
175 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  34.83 
 
 
162 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
207 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
89 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
121 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  36.25 
 
 
143 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
148 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
150 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
114 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
202 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
137 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
121 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  32.65 
 
 
724 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 
88 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  42.42 
 
 
107 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  29.92 
 
 
99 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
181 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  37.36 
 
 
837 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  41.33 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  39.29 
 
 
85 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  33.73 
 
 
732 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  38.67 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.18 
 
 
151 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.84 
 
 
116 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
90 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  33.33 
 
 
245 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
105 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  32.99 
 
 
559 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  37.33 
 
 
83 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  31.03 
 
 
134 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
104 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
94 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
87 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
94 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
90 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  34.95 
 
 
102 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  34.95 
 
 
102 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
155 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
90 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
102 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  28.95 
 
 
453 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  38.1 
 
 
87 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
88 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
110 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  26.8 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  32.47 
 
 
128 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  35 
 
 
138 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  34.48 
 
 
97 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
203 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
134 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
89 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  31.78 
 
 
1121 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
101 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
89 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>