81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04346 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  100 
 
 		 445 aa  879    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05560  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  42.25 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  45.33 
 
 		 252 aa  153  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  47.76 
 
 		 150 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45356  predicted protein  31.87 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  36.51 
 
 		 128 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  36.51 
 
 		 129 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 		 176 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  32.43 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 		 147 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  35.29 
 
 		 160 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  24 
 
 		 279 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  42.59 
 
 		 151 aa  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25.3 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 		 102 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  34.92 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 		 102 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 153 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  33.87 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  33.87 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  34.38 
 
 		 154 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  39.13 
 
 		 155 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  31.17 
 
 		 154 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 116 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 82 aa  47  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  31.03 
 
 		 246 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 		 152 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  32.26 
 
 		 154 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  25.93 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  40 
 
 		 86 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30.65 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  30.77 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.19 
 
 		 149 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.15 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  37.68 
 
 		 156 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  30.3 
 
 		 161 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 160 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  28.38 
 
 		 76 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.19 
 
 		 155 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  38.89 
 
 		 152 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  25.35 
 
 		 99 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.15 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  26.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.92 
 
 		 121 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.34 
 
 		 132 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  35.85 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  36.92 
 
 		 121 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  29.03 
 
 		 90 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  29.41 
 
 		 103 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 		 88 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  27.4 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00450  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 266 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0211998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  26.03 
 
 		 207 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  26.06 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  31.34 
 
 		 134 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  26.03 
 
 		 89 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  30.77 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.54 
 
 		 173 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  32.76 
 
 		 82 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  25.35 
 
 		 90 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  28.17 
 
 		 90 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  29.03 
 
 		 175 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  26.76 
 
 		 90 aa  43.5  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  29.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  31.34 
 
 		 114 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  31.48 
 
 		 107 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  31.15 
 
 		 148 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  26.51 
 
 		 122 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  37.04 
 
 		 149 aa  43.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  31.48 
 
 		 112 aa  43.1  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>