89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45356 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45356  predicted protein  100 
 
 		 479 aa  978    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05560  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  39.87 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  38.1 
 
 		 150 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  30.22 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  33.57 
 
 		 252 aa  87  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  43.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  28.95 
 
 		 279 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  34.78 
 
 		 184 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  35.48 
 
 		 143 aa  53.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  37.93 
 
 		 161 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  47.06 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  43.1 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  38.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  37.1 
 
 		 145 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 153 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  47.06 
 
 		 149 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 152 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  49.02 
 
 		 154 aa  50.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  36.62 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 		 114 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  45.1 
 
 		 156 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  45.1 
 
 		 155 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  45.1 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  31.76 
 
 		 154 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  35.59 
 
 		 88 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  23.47 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  47.06 
 
 		 147 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  31.82 
 
 		 67 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 		 184 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  28.24 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 		 102 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 149 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 83 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 		 90 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  46.81 
 
 		 151 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  35.37 
 
 		 319 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  32.26 
 
 		 147 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 88 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 155 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 85 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  30.88 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  40.38 
 
 		 160 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48462  predicted protein  35.14 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.38 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.41 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  42 
 
 		 121 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  32.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  33.9 
 
 		 103 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  42 
 
 		 121 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  38.3 
 
 		 107 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  31.71 
 
 		 151 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 181 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  28.21 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  42.22 
 
 		 152 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 		 115 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.43 
 
 		 88 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  38 
 
 		 123 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 150 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  30.36 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  27.47 
 
 		 552 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.58 
 
 		 87 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 89 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  38 
 
 		 122 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  33.82 
 
 		 90 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.41 
 
 		 217 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  31.25 
 
 		 158 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  38 
 
 		 124 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  28.36 
 
 		 352 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  40.43 
 
 		 88 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  40.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  27.38 
 
 		 250 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 175 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  27.38 
 
 		 250 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  28.79 
 
 		 158 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 132 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.09 
 
 		 81 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>