118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_7191 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  100 
 
 
217 aa  432  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06903  U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa (AFU_orthologue; AFUA_5G13480)  38.61 
 
 
373 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1198  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  41.41 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  31.91 
 
 
429 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  30.5 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  36.49 
 
 
450 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  33.75 
 
 
455 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  33.33 
 
 
552 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  34.29 
 
 
125 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  31.65 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  26.88 
 
 
116 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  26.39 
 
 
732 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  32.63 
 
 
119 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  32.14 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.39 
 
 
90 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  25.53 
 
 
115 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  31.25 
 
 
524 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  28.85 
 
 
109 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  35.71 
 
 
76 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
102 aa  48.5  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
102 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  34.25 
 
 
97 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 
101 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  29.11 
 
 
114 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  29.29 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  29.21 
 
 
461 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  29.07 
 
 
434 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  40.32 
 
 
109 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  31.87 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  28.21 
 
 
387 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
95 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.27 
 
 
441 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  26.32 
 
 
151 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  26.32 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  29.87 
 
 
477 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  31.82 
 
 
89 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  29.17 
 
 
572 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  32.22 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  32.86 
 
 
291 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  30.43 
 
 
81 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
615 aa  45.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  26.92 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  31.31 
 
 
99 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
89 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
175 aa  45.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  32.89 
 
 
152 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  30.77 
 
 
673 aa  45.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
132 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.58 
 
 
90 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  31.63 
 
 
98 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  32.39 
 
 
353 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  31.51 
 
 
128 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  30 
 
 
504 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  27.54 
 
 
837 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  32.43 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  27.03 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  29.67 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  29.67 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  25.68 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  29.58 
 
 
90 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  36.51 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  23.68 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 
107 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  24.66 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  30.77 
 
 
632 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  31.43 
 
 
838 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  33.72 
 
 
86 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  46.43 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  24.66 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  28.77 
 
 
95 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  29.49 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
480 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  30.11 
 
 
364 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  29.73 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  33.87 
 
 
102 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  28.57 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  28.17 
 
 
90 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48462  predicted protein  32.81 
 
 
372 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  37.7 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  31.08 
 
 
154 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.48 
 
 
103 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  26.92 
 
 
107 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  29.17 
 
 
151 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  26.32 
 
 
288 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  27.85 
 
 
112 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  37.7 
 
 
151 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>