25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44395 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44395  predicted protein  100 
 
 		 313 aa  636    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00014935  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  34.29 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  34.92 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.57 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  30.43 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  34.43 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  33.8 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  37.29 
 
 		 559 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  37.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  34.29 
 
 		 187 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  40.98 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  34.29 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.23 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.7 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.29 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  34.29 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  34.29 
 
 		 107 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  34.85 
 
 		 89 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30.51 
 
 		 112 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.51 
 
 		 107 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  32.31 
 
 		 999 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  36.23 
 
 		 134 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>