More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0262 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 587 aa  1191    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  49.74 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  51.59 
 
 		 580 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  54.79 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 604 aa  226  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 604 aa  226  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  33.58 
 
 		 567 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.23 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 531 aa  197  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.27 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  29.82 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 627 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  28.52 
 
 		 577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 597 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.59 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 561 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  26.97 
 
 		 560 aa  153  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.55 
 
 		 563 aa  151  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 579 aa  150  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 608 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 565 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.06 
 
 		 564 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  26.41 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 553 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.16 
 
 		 524 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 560 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 576 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.16 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 568 aa  113  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 645 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 512 aa  110  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.05 
 
 		 545 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.97 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 534 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 567 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.98 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.05 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 611 aa  101  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 636 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 515 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.32 
 
 		 546 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.83 
 
 		 593 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 537 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 537 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 510 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  30.1 
 
 		 537 aa  98.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 530 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.63 
 
 		 535 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 565 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 593 aa  97.4  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  27.38 
 
 		 538 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  25.21 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 		 593 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 		 593 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  25.04 
 
 		 633 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 		 593 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 		 593 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 		 593 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 531 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>