174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0924 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0924  response regulator receiver protein  100 
 
 		 359 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  30.67 
 
 		 904 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 862 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 191 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 919 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  39.06 
 
 		 879 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1932  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  43.64 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 229 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  43.64 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 522 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  28.32 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 213 aa  46.2  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  39.68 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  35 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 910 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.44 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 74 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  39.24 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0370  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  40 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  40.54 
 
 		 204 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 488 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  31.34 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  38.1 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  29.01 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0341  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.953627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  32.73 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  35.21 
 
 		 233 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 232 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2254  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1977  regulatory protein LuxR  42.11 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.62 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.77 
 
 		 230 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  41.07 
 
 		 90 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  38.46 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>