201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0485 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  43.24 
 
 
250 aa  181  6e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  31.75 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.84 
 
 
276 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  31.06 
 
 
287 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  31.06 
 
 
287 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.77 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  29.25 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  30.93 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  30.19 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30 
 
 
288 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  32.51 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
278 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.86 
 
 
391 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  32.37 
 
 
280 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  30.54 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  31 
 
 
291 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  31.12 
 
 
264 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.72 
 
 
306 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.58 
 
 
281 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
278 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.17 
 
 
281 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  30.04 
 
 
278 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  29.27 
 
 
301 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  31.25 
 
 
302 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.65 
 
 
315 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  28.57 
 
 
291 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.44 
 
 
302 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  28.78 
 
 
301 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  27.94 
 
 
298 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.54 
 
 
299 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  27.05 
 
 
298 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  28.08 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  28.78 
 
 
289 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  27.65 
 
 
325 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.08 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  27.01 
 
 
297 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  28.72 
 
 
293 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  31.1 
 
 
283 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  28.9 
 
 
279 aa  98.2  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  30.93 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.11 
 
 
319 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  25.62 
 
 
284 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.58 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  25 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  28.37 
 
 
219 aa  87  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.89 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  24 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  26.24 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  25.84 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  28.3 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  26.32 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  24.06 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  28.3 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  23.53 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  26.07 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  22.94 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  25.26 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  28.02 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  22.47 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  24.39 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.42 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  23.35 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.2 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  23.83 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.14 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  22.12 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  24.22 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  23.33 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.81 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.24 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.33 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.4 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  23.33 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.33 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  26.15 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.2 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.37 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  22.79 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.57 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.57 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.57 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.77 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  28.07 
 
 
243 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  22.86 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  22.86 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>