More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4300 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  794    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  31.83 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  32.73 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.45 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 472 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.75 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.01 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.32 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 431 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.01 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.88 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.63 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  24.47 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 452 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.5 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.7 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.86 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  27.39 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  27.42 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.03 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.11 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.2 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>