133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1776 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 387 aa  750    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 401 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  65.09 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  65.62 
 
 		 395 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  63.59 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  66.93 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  63.52 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  65.73 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  53.14 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.44 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  22.56 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.81 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  20.87 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.3 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  25.22 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  25.07 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.07 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 513 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  27.27 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  26.29 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.05 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 514 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  31.17 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  27.33 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.21 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 462 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.84 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  26.8 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  21.69 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  22.06 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  24.7 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  23.39 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  21.82 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.9 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.99 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.34 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.12 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  26.15 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>