More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05679 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 507 aa  1043    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  91.91 
 
 		 507 aa  942    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  63.66 
 
 		 627 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  62.25 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  55.19 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  55.38 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  55.19 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  55.19 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  55.88 
 
 		 513 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  54.79 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  54.4 
 
 		 513 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  51.63 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  50.62 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  52.61 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  48.57 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  46.07 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  46.44 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  46.31 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  45.62 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  45.62 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  46.03 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  46.23 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  45.45 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  46.03 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  45.21 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  46.03 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  46.03 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  45.62 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  45.42 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  46.03 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  45.82 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  45.55 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  43.6 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  43.51 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  43.6 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  43.92 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  38.01 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  39.52 
 
 		 516 aa  310  5e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  38.29 
 
 		 623 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.85 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  29.25 
 
 		 456 aa  138  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.27 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.27 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.92 
 
 		 364 aa  107  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  27.14 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  24.1 
 
 		 517 aa  86.7  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.56 
 
 		 1855 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  23.98 
 
 		 607 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  21.76 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  23.6 
 
 		 1116 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.91 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  23.6 
 
 		 1116 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  23.06 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  21.08 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  22.34 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  25.16 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 878 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.15 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  22.89 
 
 		 527 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  23.94 
 
 		 1099 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  23.81 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.17 
 
 		 1891 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.18 
 
 		 1942 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.26 
 
 		 1975 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  22.34 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.88 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 1005 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.88 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  24.38 
 
 		 1098 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.91 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  23.82 
 
 		 1111 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.39 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  23.2 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 		 1017 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  23.2 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  23.2 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  25.47 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.6 
 
 		 1114 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  22.01 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  23.58 
 
 		 1112 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  23.78 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  23.65 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  25.12 
 
 		 1108 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.5 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 614 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  22.57 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.05 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>