80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1027 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  773    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  43.78 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  34.95 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  36.84 
 
 		 369 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  34.3 
 
 		 371 aa  195  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  33.59 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  33.33 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  30.75 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  30.42 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  39.07 
 
 		 224 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  40.46 
 
 		 227 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.49 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.29 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  39.5 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  44.07 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  43.22 
 
 		 478 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  24.49 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  37.61 
 
 		 451 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  35.88 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  33.83 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.08 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  24.68 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  23.83 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  30.77 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  30 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  37.78 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  31.67 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.29 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  29.37 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  30.41 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  30.6 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.22 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  35.59 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  23.86 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  33.96 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  28.47 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  23.93 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  35.96 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 572 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  22.78 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  39.71 
 
 		 565 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  26.55 
 
 		 617 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  30.97 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  44.62 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  34.02 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.93 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  35.63 
 
 		 96 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  38.46 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.93 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  42.19 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  23.5 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.58 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  43.75 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  29.89 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  27.42 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  44.19 
 
 		 583 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  31.48 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  27.71 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  30.21 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  33.33 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  21.34 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  31.07 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.89 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.89 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.29 
 
 		 615 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  27.42 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  32.43 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  30.77 
 
 		 564 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.11 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  29.17 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.59 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.94 
 
 		 689 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  25.79 
 
 		 714 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.45 
 
 		 674 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0895  hypothetical protein  27.08 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.295883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>