More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0530 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  61.38 
 
 		 191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  60.85 
 
 		 191 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  49.73 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 196 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 193 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 218 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  30.11 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
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NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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