89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2746 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 274 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 243 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  32.57 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  46.77 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.9 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 371 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 217 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.94 
 
 		 195 aa  42  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  39.76 
 
 		 191 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 194 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.82 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  32.39 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>