More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2512 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  100 
 
 		 310 aa  603  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  65.8 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  64.78 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  64.78 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  64.78 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  63.46 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  63.79 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  63.02 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.31 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  60.07 
 
 		 388 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  56.91 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  61.15 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  56.13 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  55.84 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  53.72 
 
 		 314 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.87 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  56.03 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  52.24 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  50.49 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  54.87 
 
 		 334 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 329 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  47.02 
 
 		 319 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.83 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.19 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.56 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  43.21 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.14 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.94 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  41.31 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.94 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 305 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.19 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.7 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.86 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.97 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  40.79 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.16 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  42.72 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.83 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.17 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.83 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  44.92 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.8 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.72 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  42.75 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.09 
 
 		 283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.24 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.66 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  41.31 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.04 
 
 		 741 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.7 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.79 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.91 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.14 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  36.98 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  43.36 
 
 		 512 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  45.45 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 237 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.72 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  46.26 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.74 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.06 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.45 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  42.69 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  42.69 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  45.02 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.18 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.14 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>