174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0854 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  39.26 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  38.05 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.08 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  34.34 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  37.33 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  34.74 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  30.98 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  30.6 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.68 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.56 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  33.89 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  30.58 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  30.1 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  31.27 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  31.07 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  30.24 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  30.24 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  30.24 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  30.07 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  29.33 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  29.33 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  29.33 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  29.31 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.38 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  28.38 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.69 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.19 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.27 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.56 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  30.05 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  22.87 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  34.43 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  27.51 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  30.71 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.53 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.53 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  21.86 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  22.14 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  28.39 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  24.18 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  28.67 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  23.13 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.4 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  23.64 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  29.67 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 414 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  27.43 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  27.16 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  27.71 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  27.27 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  26.51 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  30.97 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  24.84 
 
 		 392 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  25.97 
 
 		 338 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  30.11 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.63 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  23.03 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>