More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3826 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  68.78 
 
 
242 aa  331  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  67.9 
 
 
243 aa  312  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  67.09 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  66.95 
 
 
236 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  63.98 
 
 
236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  63.95 
 
 
236 aa  295  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  60.76 
 
 
236 aa  292  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  65.96 
 
 
236 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.52 
 
 
234 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  61.37 
 
 
235 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  54.94 
 
 
233 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 
239 aa  254  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  54.89 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  54.24 
 
 
237 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  58.8 
 
 
230 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  51.07 
 
 
232 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  54.51 
 
 
233 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  53.22 
 
 
233 aa  245  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  53.22 
 
 
233 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  52.36 
 
 
232 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  54.66 
 
 
230 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  54.08 
 
 
229 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  48.51 
 
 
240 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  48.31 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  49.37 
 
 
237 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  52.56 
 
 
228 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  52.34 
 
 
236 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  48.94 
 
 
243 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  53.19 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  49.79 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  46.84 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  49.79 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.5 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  49.16 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  47.26 
 
 
237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  48.95 
 
 
237 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  49.34 
 
 
239 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  48.12 
 
 
237 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  48.71 
 
 
823 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  47.28 
 
 
237 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  48.93 
 
 
246 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  46.84 
 
 
237 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
236 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  48.28 
 
 
823 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  47.03 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.69 
 
 
231 aa  197  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.07 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  46.58 
 
 
244 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.58 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.98 
 
 
236 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.35 
 
 
231 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.35 
 
 
231 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.4 
 
 
236 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.78 
 
 
254 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  47.03 
 
 
238 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  47.88 
 
 
827 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  44.02 
 
 
243 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.92 
 
 
235 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  46.98 
 
 
822 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.83 
 
 
237 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
238 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
238 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.35 
 
 
238 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  44.54 
 
 
252 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.02 
 
 
235 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.3 
 
 
234 aa  190  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.11 
 
 
248 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.21 
 
 
233 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.26 
 
 
236 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.49 
 
 
248 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.21 
 
 
234 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.3 
 
 
248 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.84 
 
 
236 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  45.3 
 
 
237 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.8 
 
 
232 aa  187  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.35 
 
 
235 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.85 
 
 
234 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.09 
 
 
237 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
235 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  46.35 
 
 
251 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  44.3 
 
 
251 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.28 
 
 
244 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  44.87 
 
 
234 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.66 
 
 
242 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  44.07 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  44.07 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  42.24 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  44.44 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.78 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>