More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0797 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  100 
 
 		 148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  43.9 
 
 		 169 aa  116  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  46.62 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  50.98 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  53.47 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  44.22 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.35 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  44.76 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  44.97 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  40.94 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.8 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  45.52 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  42.26 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  39.33 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  49.01 
 
 		 161 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  40.78 
 
 		 178 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  37.75 
 
 		 182 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  41.82 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  42.45 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  39.31 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  40.48 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  38.79 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  42.55 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  43.86 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  38.73 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.98 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  39.39 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  33.54 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.57 
 
 		 167 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  40.29 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  63.01 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.88 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  38.22 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  72.22 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.78 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  37.67 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  54.79 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  48.57 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  35.23 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  33.33 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  47.14 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  38.27 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  42.28 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  36.9 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  36.99 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  36.9 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  36.9 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.42 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  35.71 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  38.19 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.15 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  37.66 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.56 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  38.06 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  36.57 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  39.13 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  37.59 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0269  fimbrial protein pilin  45.16 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372108  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  47.5 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.44 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  37.93 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  37.32 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  63.79 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  32.74 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  44.3 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  64.29 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  36.36 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  47.89 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.54 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  61.4 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  43.28 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  53.85 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46.38 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  33.12 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  44.3 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  32.69 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  59.26 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  35.86 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  43.62 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0014  type IV pilin structural subunit  38.76 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  32.62 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.43 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  39.13 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  52.73 
 
 		 438 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  33.62 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  42.35 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  85.29 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0777  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.47 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  37.5 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  33.1 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  39.55 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  65.38 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  65.22 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  44.59 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>