105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2620 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  58.38 
 
 
182 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  56.07 
 
 
182 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  47.8 
 
 
183 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  45.05 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  42.78 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  45.9 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  42.22 
 
 
189 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  41.67 
 
 
180 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  45.09 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  42.77 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  44.86 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  39.01 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  40.11 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  39.01 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  40.11 
 
 
184 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  40.11 
 
 
184 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  38.89 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  45.32 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  39.87 
 
 
189 aa  94.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  37.97 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  38.51 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  47.06 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.26 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  37.59 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  39.24 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  36.98 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.71 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  31.71 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  42.37 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.78 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  31.18 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  28.88 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  34.07 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.52 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  36.67 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.22 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  33.83 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  29.19 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  54.17 
 
 
262 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  30.27 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  30.86 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  29.67 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  32.4 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  38.96 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  32.41 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  34.38 
 
 
191 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  30.6 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  48.28 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  32.52 
 
 
200 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  28.41 
 
 
192 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  28.41 
 
 
192 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  46.81 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  38.24 
 
 
210 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  33.02 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  34.56 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  40.98 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  42.86 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  38.98 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  41.89 
 
 
166 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  34.33 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  37.04 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  40.38 
 
 
155 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  29.5 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30.57 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  34.33 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  42.62 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  32.88 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  45.65 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  25.73 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  29.5 
 
 
208 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  26.21 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  47.06 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  36 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  29.27 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  37.04 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  43.48 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  27.12 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  24.22 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  33.03 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  38.33 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  38.24 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  32.47 
 
 
182 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  37.74 
 
 
210 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  31.46 
 
 
207 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>