85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4963 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  90.71 
 
 
183 aa  344  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  86.81 
 
 
184 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  86.81 
 
 
184 aa  323  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  86.81 
 
 
184 aa  323  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  51.93 
 
 
180 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  51.61 
 
 
183 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  46.74 
 
 
189 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  47.98 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  44.57 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  46.24 
 
 
181 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  44.81 
 
 
180 aa  141  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  48.07 
 
 
186 aa  141  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  48.07 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  43.48 
 
 
182 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  40.66 
 
 
187 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  37.14 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  37.14 
 
 
182 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  34.68 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  37.4 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  31.38 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  33.73 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  37.86 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  32.37 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  34.19 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  34.07 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  59.09 
 
 
262 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  34.04 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  48.39 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  30.81 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  33.04 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  36.54 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  25.7 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  31.69 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  36.54 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.03 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  30.39 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  26.95 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  33.64 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  37.29 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  27.27 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  35.24 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  35.59 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  34.06 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30.83 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  31 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  42.55 
 
 
190 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  26.79 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  29.25 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  31.52 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  23.49 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  35.62 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  36.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  26.79 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.29 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  29.8 
 
 
177 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  37.68 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  28.15 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  35.48 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  36.21 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  28.81 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  27.46 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  27.27 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1332  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0870238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  28.18 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  33.9 
 
 
206 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  32.65 
 
 
192 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  32.65 
 
 
192 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  27.07 
 
 
183 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  40.43 
 
 
197 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  33.98 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  36.07 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>