53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4790 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  48.52 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  53.33 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  48.59 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  36.31 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  36.87 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  35.26 
 
 		 189 aa  84.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  84  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  38.89 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  35.93 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.99 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  33.69 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  41 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  38.39 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  33.53 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  38 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.07 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  30.46 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.31 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  34.29 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  30.85 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.05 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.42 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.47 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  31.79 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  32.4 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  34.41 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  34.41 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.17 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  34.31 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  30.56 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  30.91 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  36.17 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  29.46 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  30.4 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  27.17 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  53.85 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  26.44 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  27.87 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  51.92 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  43.24 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  31 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  31.29 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>