58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2347 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
171 aa  353  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  34.46 
 
 
177 aa  90.5  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  46.6 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  40.17 
 
 
192 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  33.52 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.67 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  38.61 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  38.61 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  35.85 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  34.15 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.6 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  31.95 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  35.37 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  39.6 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  40.82 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  31.98 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  35.98 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  32.6 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  35.92 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  39.42 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  39.42 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  39.42 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  33.08 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.62 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  34.74 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  30.06 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  31.71 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  32.67 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  31.37 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  36.54 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  34.04 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  29.01 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  32.5 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  32.65 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  36.9 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  31.13 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  46 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  28.1 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  34.83 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  29.51 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  31.58 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  33.65 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  33.75 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  35.56 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  52.78 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  35.14 
 
 
181 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  31.91 
 
 
219 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  31.91 
 
 
219 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  37.93 
 
 
191 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  23.36 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>