113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3324 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  93.78 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  46.52 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  47.8 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  37.17 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  36.22 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  35.87 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  35.87 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  35.64 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  36.22 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  35.15 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  33.17 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  29.44 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  30.1 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  29.59 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  30.1 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  30.1 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  30.1 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  30.1 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  31.84 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  31.66 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  30.6 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  27.89 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  27.08 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  30.73 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  28.95 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.67 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  27.66 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  27.46 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  27.46 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  28.88 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  32.09 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  27.54 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  55.56 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  33.58 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  40.3 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  27.23 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  51.16 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  27.84 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  23.63 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  24.5 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  40.3 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  26.56 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  29.11 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  40.62 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0464  protein of unknown function DUF1470  30.48 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  38.03 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  38.81 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  42.65 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  26.29 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  43.1 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  25.56 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  44.44 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  37.29 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  37.29 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  37.29 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  41.38 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  29.85 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  24 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  35.06 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.93 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  36.21 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  54.29 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  35.59 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  36.11 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  29.1 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  35.59 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  41.27 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  37.1 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  45.1 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  31.13 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  23.66 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  25.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  24.1 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  30.19 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  51.43 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  26.04 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  33.73 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  46.3 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  32.86 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0440  protein of unknown function DUF1470  41.3 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  28.57 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  32.56 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  28.16 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  38.1 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  26.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  37.93 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  39.22 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  31.4 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  28.79 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  24.29 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>