95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2325 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  50.54 
 
 
208 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  36.76 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  34.95 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  39.25 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.98 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  34.39 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  33.52 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  35.96 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  32.42 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  32.42 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  32.16 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  33.7 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  41.25 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  39.78 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  35.92 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  46.03 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  34.04 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  29.89 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  28.88 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  31.15 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  34.48 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  31.15 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  43.33 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  30.53 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0440  protein of unknown function DUF1470  37.1 
 
 
167 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  31.47 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  30.63 
 
 
167 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  44.29 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  27.62 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  31.17 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  28.92 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  33.66 
 
 
211 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  32.18 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  48.08 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  26.42 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  35.11 
 
 
189 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  47.06 
 
 
219 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  29.19 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  29.74 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  28.98 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  29.06 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  31.02 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  37.84 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  29.38 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  30.2 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  27.89 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  38.89 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  33.02 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  33.64 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  27.59 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  30.77 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  43.48 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  29.02 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  34.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  28.91 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  29.34 
 
 
184 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  48 
 
 
186 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  29.7 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  29.7 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  27.59 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  26.26 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  28.99 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  29.89 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  24.58 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  43.4 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  45.95 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0464  protein of unknown function DUF1470  54.05 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  44.44 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  43.4 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  34.52 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  31.87 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  29.69 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  28.02 
 
 
174 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  26.35 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  35.71 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>