67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5618 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  36.55 
 
 
211 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  28.78 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  33.67 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  35.38 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  35.18 
 
 
211 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  37.44 
 
 
219 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  32 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  36.27 
 
 
226 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  32.79 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  29.06 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  31.02 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  29.81 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  29.81 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  31.09 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.82 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  33.16 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  32.12 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.8 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  26.37 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  26.6 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  28.24 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  27.36 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  27 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  25.89 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.21 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  28.86 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  27.49 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  26.15 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  39.51 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  27.17 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  30.11 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  27.37 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  25.49 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  24 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  26.29 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  30.08 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  31.02 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  39.74 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  28.21 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  45.1 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  26.15 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  25.14 
 
 
182 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  29.32 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  30.1 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  32.58 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  22.01 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  48.84 
 
 
176 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  26.02 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  36.47 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  29.23 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  39.29 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  38.1 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  35.71 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>