95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0212 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  94.98 
 
 		 219 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  43.28 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  41.71 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  37.13 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  37.62 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  39.41 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  36.17 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  35.65 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  35.65 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  37.23 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  34.72 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  35.02 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  36.82 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  37.93 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  34.39 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  35.12 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  32.66 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  33.65 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  33.65 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  34.02 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  24.87 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.47 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  32.14 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  30.05 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  54.39 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  31.16 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  29.35 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  43.21 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  25.87 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  31.92 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  32.31 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  35.82 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  31.22 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  24.88 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  55.56 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  53.45 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  45.78 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  31.84 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  46.43 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  28.36 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  29.53 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  27.14 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  54.35 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  31.34 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  27.96 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.05 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  54.35 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  29.63 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  41.43 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  29.53 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  45.21 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  46.81 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  43.4 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  31.79 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0440  protein of unknown function DUF1470  44.68 
 
 		 167 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  39.66 
 
 		 182 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  38.24 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  39.66 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  52.78 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  39.66 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  27.6 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  39.66 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  39.66 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  40.58 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  30.5 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  30.5 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  47.37 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  34.85 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  32.81 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  48.48 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  34.43 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  47.37 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  47.06 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  35.71 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  43.75 
 
 		 200 aa  42  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>