129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1178 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  67.63 
 
 		 182 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  58.38 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  43.41 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  44.51 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  39.23 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  38.89 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  35.16 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  38.76 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  38.38 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  39.77 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  38.38 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  38.38 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  41.86 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  38.01 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  36.67 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  39.2 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  46.09 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  39.49 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  37.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  33.16 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  39.62 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  37.06 
 
 		 216 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  35.75 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  38.75 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.03 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  28.04 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  39.85 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  35.62 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  35.63 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.63 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  35.44 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  36.75 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  36.88 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  33.52 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  28.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  26.23 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  32.52 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  32.4 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  30.46 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  32.54 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  32.34 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  39.53 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  32.81 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  27.5 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  37.93 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  30.28 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.28 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  43.4 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  33.08 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  42.65 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  44.9 
 
 		 262 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  34.25 
 
 		 233 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  36.11 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  38.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  36.11 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  47.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  37.14 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.11 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.07 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  36.11 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  27.78 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  34.72 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  41.07 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  31.41 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  31.11 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  30.06 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  27.07 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0870238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  30.19 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  24.49 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  28.34 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  39.13 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  28.18 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  39.29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  28.18 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.62 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  24.39 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  32.39 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  44.19 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  27.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  28.04 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  31.45 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  55.88 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  25.29 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>