74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0917 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  51.1 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  49.72 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  47.7 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  48.04 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  44.26 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  43.48 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  43.48 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  43.41 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  44.26 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  44.26 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  44.26 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  43.09 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  43.17 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  41.53 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  43.43 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  36.78 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  35.06 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.43 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.54 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  40.98 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  39.32 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  44.12 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  36.22 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.26 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  38.32 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  33.93 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  34.05 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.72 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  34.75 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  30.41 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  34.21 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  32.73 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32.45 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  33.63 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  32.14 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  25.7 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  31.71 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  32.43 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  29.08 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  29.17 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  31.43 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.37 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  52.38 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.51 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  38.71 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1332  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0870238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  38.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  40.28 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  36.92 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  26.42 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  36.23 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  29.66 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  39.71 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  35.59 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  31.37 
 
 		 208 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  28.42 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  26.35 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>