91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1791 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  57.63 
 
 
187 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  55.49 
 
 
183 aa  180  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  53.01 
 
 
183 aa  180  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  50.28 
 
 
181 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  50.28 
 
 
180 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  50.9 
 
 
181 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  47.54 
 
 
183 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  47.34 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  46.7 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  46.7 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  46.7 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  47.22 
 
 
186 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  44.81 
 
 
183 aa  141  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  43.89 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  43.09 
 
 
182 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.84 
 
 
192 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  45.54 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  32.96 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  41.58 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  37.38 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.71 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.29 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  35.26 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.72 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  38.68 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  36.11 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  31.32 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  36.89 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.29 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  31.78 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  38.39 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  35.98 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  36.56 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  31.73 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  32.48 
 
 
191 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  35.35 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  30.15 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  32.56 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.86 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  35.77 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  30.88 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  29.2 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  30.08 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  37.76 
 
 
262 aa  48.5  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  35.44 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  36.8 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  48.08 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  30.08 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  33.66 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  30.08 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  29.46 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  28.91 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  29.71 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  36.71 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  38.67 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  33.77 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  39.13 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.51 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  31.82 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  27.21 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  26.23 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  28.99 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  34.92 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  33.85 
 
 
192 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  36.25 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  31.34 
 
 
210 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  32.31 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  34.72 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  33.75 
 
 
182 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  33.75 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  33.75 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  33.75 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  36.25 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  30.43 
 
 
205 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  34.85 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  27.18 
 
 
190 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>