76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4103 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  363  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  76.47 
 
 
181 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  56.28 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  50.55 
 
 
183 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  51.93 
 
 
184 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  51.93 
 
 
183 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  51.93 
 
 
184 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  51.93 
 
 
184 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  51.38 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  51.69 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  46.96 
 
 
189 aa  170  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  50.28 
 
 
180 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  46.47 
 
 
181 aa  151  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  47.19 
 
 
181 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  44.26 
 
 
182 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  39.88 
 
 
186 aa  124  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  37.04 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  42.99 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.59 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  40.5 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  37.8 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  35.5 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  44.44 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  37.36 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.62 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  32.86 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  38.53 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  33.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  37.74 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  58.14 
 
 
262 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  35.58 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  31.25 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  30.71 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  32.53 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  28.39 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  38.54 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  37.04 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.93 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  33.08 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.07 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  30.77 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  28.12 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  37.93 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  27.82 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  33.02 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  37.25 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  29.82 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.21 
 
 
192 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  34.92 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  27.88 
 
 
206 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  36.92 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  25.49 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  42.55 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  34.29 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  27.65 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  39.86 
 
 
182 aa  44.3  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  27.88 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  37.65 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  27.62 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  32.39 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  27.62 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  40.91 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  39.13 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  28.7 
 
 
210 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  34.62 
 
 
208 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  36.54 
 
 
196 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  29.02 
 
 
199 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>