48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0341 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  89.23 
 
 		 195 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  63.8 
 
 		 178 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  39.53 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  42.53 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  42.61 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  38.92 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  42.34 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  36.91 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  37.82 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  33.15 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  34.71 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  37.37 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  28.04 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  34.66 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  33.88 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  42 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.37 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  31.52 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  40.43 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  35.58 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  29.65 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32.8 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  34.75 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  35.51 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  29.91 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  28.83 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  29.26 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  30.69 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  32.38 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  31.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  28.66 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  28.81 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  27.39 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  27.39 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  27.39 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  32.63 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  46.67 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>