60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4083 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  52.02 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  52.03 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  46.84 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  40.94 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35.63 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.43 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  42.16 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  40 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  33.73 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  38.66 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  36.04 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  31.36 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  37.76 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  35.51 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  35.85 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  33.12 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  35.96 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.46 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  36.89 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  34.55 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.79 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  33.98 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  33 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  29.37 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  31.43 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  31 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30.38 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  31.13 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  38.96 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  35.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  35.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  35.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  32.38 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  30.32 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  28.49 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  34.26 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  38.81 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  31.19 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  47.54 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  46.67 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  26.42 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  35.56 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  28.44 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 		 216 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>