49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4814 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  52.02 
 
 
169 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  46.01 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  47.71 
 
 
164 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  37.7 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.02 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  32.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  32.58 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  40 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.43 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  32.22 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  42.31 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.61 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  36.11 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  38.68 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.74 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.22 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  32.75 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  34.21 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.97 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.37 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  37.37 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  31.9 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  32.6 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  38.66 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  36.96 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  34.26 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  28.33 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  30.84 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  30.65 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  34.58 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  38.95 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.06 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  28.8 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  29.37 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  37.76 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  32.2 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  31.9 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  31.9 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  31.9 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
197 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  28.81 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  31.67 
 
 
200 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.71 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>