77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4616 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  64.17 
 
 
187 aa  220  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  58.73 
 
 
189 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  44.97 
 
 
187 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  37.37 
 
 
187 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  38.06 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  38.79 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  33.52 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  33.14 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  35.53 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.84 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  35.34 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  39.2 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  34.76 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  33.51 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.26 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  32.22 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  38.06 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  35.56 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  36.88 
 
 
175 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  37.78 
 
 
183 aa  84.3  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  33.74 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  38.85 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  34.39 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  35.43 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.22 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.1 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  32.93 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35.34 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  36.59 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  38.02 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  30.86 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  37.6 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  38.17 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  36.04 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  37.4 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  38.93 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  36.29 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  40.17 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  31.07 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.58 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  33.03 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  33.03 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  46.48 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  26.7 
 
 
193 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  53.49 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  38.36 
 
 
176 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  48 
 
 
166 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  38.89 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  26.86 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  34.93 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  44.44 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  44.64 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  46.51 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  49.02 
 
 
200 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  45.45 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  43.08 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  48.89 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  40.32 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  47.92 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  42.59 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  42.59 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  42.59 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  45.45 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  40.74 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  30.56 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  30.56 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  32.26 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  37.74 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  32.26 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  42.11 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  51.16 
 
 
194 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>